Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20538F6Z9R1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms