Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17093F6XGJ4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm17093F6XGJ4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms