Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5407E9Q7Q1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5407E9Q7Q1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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