Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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Ddx60E9PZQ1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
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Ddx60E9PZQ1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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Ddx60E9PZQ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddx60E9PZQ1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
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Ddx60E9PZQ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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Ddx60E9PZQ1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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Ddx60E9PZQ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
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Ddx60E9PZQ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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Ddx60E9PZQ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddx60E9PZQ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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