Protein–RNA interactions for Protein: E0CXI6

Gm5286, Predicted gene 5286, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5286E0CXI6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5286E0CXI6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5286E0CXI6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms