Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim12cD3Z3L3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim12cD3Z3L3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim12cD3Z3L3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms