Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brpf3B2KF05 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Brpf3B2KF05 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Brpf3B2KF05 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms