Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
AU022751B1B0V2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
AU022751B1B0V2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AU022751B1B0V2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AU022751B1B0V2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms