Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Skint2A7XUX6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skint2A7XUX6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms