Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef6A2A8M8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pramef6A2A8M8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pramef6A2A8M8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms