Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calcoco2A2A6M5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Calcoco2A2A6M5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms