Protein–RNA interactions for Protein: A0A140T8N6

Trbv13-2, T cell receptor beta, variable 13-2 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-2A0A140T8N6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv13-2A0A140T8N6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trbv13-2A0A140T8N6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trbv13-2A0A140T8N6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Trbv13-2A0A140T8N6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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