Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms