Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Olfr209-203ENSMUST00000208875 1194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Pdk4-201ENSMUST00000019721 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Akt2-204ENSMUST00000108343 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm43813-201ENSMUST00000196847 2294 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Ttc16-205ENSMUST00000161089 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Olfr450-202ENSMUST00000218832 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Phf8-206ENSMUST00000112670 3484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Olfr1221-203ENSMUST00000213404 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Polr3c-206ENSMUST00000154679 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Polr3f-202ENSMUST00000110017 1632 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Lnpk-203ENSMUST00000111993 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Cnbd2-203ENSMUST00000109580 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Lrrc8d-202ENSMUST00000120847 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Pitrm1-207ENSMUST00000222485 3906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm43412-201ENSMUST00000197455 2818 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Arhgap45-203ENSMUST00000105373 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Ube2f-203ENSMUST00000171165 5654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 BC025920-202ENSMUST00000119492 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 A230056P14Rik-201ENSMUST00000130189 2177 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Akap6-202ENSMUST00000219786 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm17816-201ENSMUST00000219991 2603 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 AC102847.1-201ENSMUST00000228390 2498 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Acot11-201ENSMUST00000065253 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Ptk2-209ENSMUST00000226988 4444 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm35048-201ENSMUST00000192105 2802 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm44070-201ENSMUST00000203389 2220 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Apol7b-201ENSMUST00000089469 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Derl3Q9D8K3 Gm45153-201ENSMUST00000205957 1901 ntBASIC8.84□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Atg14-201ENSMUST00000042988 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Rexo5-203ENSMUST00000106520 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms