Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Crx-201ENSMUST00000044434 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Zdhhc9-201ENSMUST00000037960 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Sf3a3-201ENSMUST00000030734 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm39312-201ENSMUST00000213586 2195 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm12645-201ENSMUST00000117297 275 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm13472-201ENSMUST00000120948 314 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 1700057H15Rik-202ENSMUST00000143859 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Opn1mw-201ENSMUST00000033771 1227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 BC051665-201ENSMUST00000026078 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 AC110091.2-201ENSMUST00000215107 1512 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Xrcc5-201ENSMUST00000027379 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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PtprdQ64487 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PtprdQ64487 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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