Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Olfr73-202ENSMUST00000129056 3048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Elmo1-201ENSMUST00000072519 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Cldn12-207ENSMUST00000179804 3752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Adamtsl3-203ENSMUST00000173287 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 AC166165.1-201ENSMUST00000214352 874 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Sh3kbp1-204ENSMUST00000112451 3914 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Diexf-201ENSMUST00000085555 5570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Pde11a-201ENSMUST00000099992 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Cd22-213ENSMUST00000190617 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Prim1-201ENSMUST00000026461 1583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm19410-201ENSMUST00000207505 6352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Serpinb9c-201ENSMUST00000021837 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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