Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Cdh16-213ENSMUST00000212882 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm19127-201ENSMUST00000207067 2445 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Dpysl3-202ENSMUST00000118043 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Auts2-217ENSMUST00000187544 3166 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Baiap3-204ENSMUST00000182435 3758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Camk2a-201ENSMUST00000025519 3244 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Man2b1-201ENSMUST00000034121 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Urod-201ENSMUST00000030446 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Prpf39-201ENSMUST00000120580 4069 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ctcflos-204ENSMUST00000153523 3476 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 2410002F23Rik-202ENSMUST00000071296 4201 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Pln-202ENSMUST00000163319 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ank3-219ENSMUST00000182437 3113 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Rnmt-202ENSMUST00000025427 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Zfp84-201ENSMUST00000032802 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ces1e-201ENSMUST00000034173 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Il17rd-205ENSMUST00000226105 2923 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm11218-201ENSMUST00000121364 1214 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gpatch2-206ENSMUST00000160471 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gprasp2-211ENSMUST00000173804 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm43480-201ENSMUST00000201201 416 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 4930435N07Rik-201ENSMUST00000208065 2127 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ednrb-202ENSMUST00000172237 3989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Scn3b-202ENSMUST00000114956 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Rnf141-204ENSMUST00000175981 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Hmgcs1-202ENSMUST00000224188 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Bcl2l14-202ENSMUST00000111960 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Zswim3-201ENSMUST00000052107 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Sult5a1-201ENSMUST00000000755 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm26911-201ENSMUST00000181770 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Commd2-202ENSMUST00000160959 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Strn-201ENSMUST00000024881 2967 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Eny2-201ENSMUST00000060652 3000 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Bmf-201ENSMUST00000090219 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Ece2-207ENSMUST00000079600 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm40999-201ENSMUST00000222586 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Irx2P81066 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms