Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp12Q9D9M2 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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