Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 G6pc-201ENSMUST00000019469 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm6351-203ENSMUST00000139828 1542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Noxred1-203ENSMUST00000222480 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm11279-201ENSMUST00000121524 1256 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Rspo4os-201ENSMUST00000152229 1281 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm22762-201ENSMUST00000157395 137 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Ube2i-214ENSMUST00000174216 1144 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm10045-201ENSMUST00000178657 483 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm36569-201ENSMUST00000195082 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm34358-201ENSMUST00000204585 665 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm39128-201ENSMUST00000208237 1094 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm45538-201ENSMUST00000210771 1061 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 AC068459.1-201ENSMUST00000222492 905 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 AC164315.1-202ENSMUST00000226723 657 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 AC161763.1-201ENSMUST00000227063 168 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Sh2d1a-201ENSMUST00000005839 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Tmx2-202ENSMUST00000111664 1926 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Dntt-202ENSMUST00000112200 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Stard4-202ENSMUST00000118990 648 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm22609-201ENSMUST00000158286 121 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Pou1f1-203ENSMUST00000176038 1174 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm6073-201ENSMUST00000198253 466 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 AC124173.1-201ENSMUST00000223701 189 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Retnlg-201ENSMUST00000065666 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Aadacl4-201ENSMUST00000094510 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm6682-201ENSMUST00000169666 1346 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm9583-201ENSMUST00000219613 1843 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm12004-201ENSMUST00000117869 718 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 n-R5s175-201ENSMUST00000122599 117 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm13564-201ENSMUST00000131533 657 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm13855-201ENSMUST00000145644 744 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Coq8a-208ENSMUST00000160879 561 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Gm7125-201ENSMUST00000093430 273 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Col5a3Q9JLI2 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 2900052N01Rik-203ENSMUST00000191603 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Arhgap10-203ENSMUST00000210922 2208 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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