Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rnf169E9Q7F2 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Rnf169E9Q7F2 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf169E9Q7F2 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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