Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Mbnl1-203ENSMUST00000191747 4046 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Cpsf3-211ENSMUST00000222968 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rad54bQ6PFE3 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rad54bQ6PFE3 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Thap2-201ENSMUST00000020346 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rad54bQ6PFE3 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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