Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
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Gm21976J3QNN2 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Gm21976J3QNN2 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Gm21976J3QNN2 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Gm21976J3QNN2 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Gm21976J3QNN2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Gm21976J3QNN2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Gm21976J3QNN2 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Gm21976J3QNN2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Gm21976J3QNN2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Gm21976J3QNN2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Gm21976J3QNN2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Gm21976J3QNN2 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Gm21976J3QNN2 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Gm21976J3QNN2 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm21976J3QNN2 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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