Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gria4Q9Z2W8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria4Q9Z2W8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms