Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk1bQ9Z2C6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Upk1bQ9Z2C6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upk1bQ9Z2C6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms