Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z266

Snapin, SNARE-associated protein Snapin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnapinQ9Z266 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SnapinQ9Z266 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnapinQ9Z266 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms