Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0X0

Cdc42ep5, Cdc42 effector protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdc42ep5Q9Z0X0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms