Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PplQ9R269 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PplQ9R269 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PplQ9R269 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PplQ9R269 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PplQ9R269 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PplQ9R269 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PplQ9R269 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PplQ9R269 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PplQ9R269 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PplQ9R269 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PplQ9R269 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PplQ9R269 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PplQ9R269 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PplQ9R269 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PplQ9R269 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PplQ9R269 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PplQ9R269 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PplQ9R269 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms