Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trpc2Q9R244 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trpc2Q9R244 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trpc2Q9R244 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpc2Q9R244 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpc2Q9R244 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpc2Q9R244 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpc2Q9R244 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpc2Q9R244 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpc2Q9R244 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Trpc2Q9R244 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms