Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp2b2Q9R0K7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp2b2Q9R0K7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2b2Q9R0K7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2b2Q9R0K7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2b2Q9R0K7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2b2Q9R0K7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2b2Q9R0K7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2b2Q9R0K7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2b2Q9R0K7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Atp2b2Q9R0K7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atp2b2Q9R0K7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp2b2Q9R0K7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp2b2Q9R0K7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b2Q9R0K7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b2Q9R0K7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b2Q9R0K7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b2Q9R0K7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b2Q9R0K7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b2Q9R0K7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms