Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Irx4Q9QY61 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irx4Q9QY61 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms