Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Opn4Q9QXZ9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn4Q9QXZ9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms