Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc2lQ9JME7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trappc2lQ9JME7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms