Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap4m1Q9JKC7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4m1Q9JKC7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4m1Q9JKC7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms