Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms