Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfrsf23Q9ER63 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfrsf23Q9ER63 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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