Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPT1

Vmn1r63, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r63Q9EPT1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r63Q9EPT1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r63Q9EPT1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms