Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gpr88Q9EPB7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Gpr88Q9EPB7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpr88Q9EPB7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpr88Q9EPB7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpr88Q9EPB7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpr88Q9EPB7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpr88Q9EPB7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpr88Q9EPB7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpr88Q9EPB7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms