Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Eif3fQ9DCH4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3fQ9DCH4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3fQ9DCH4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms