Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tomm20Q9DCC8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tomm20Q9DCC8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tomm20Q9DCC8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tomm20Q9DCC8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tomm20Q9DCC8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tomm20Q9DCC8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tomm20Q9DCC8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tomm20Q9DCC8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tomm20Q9DCC8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tomm20Q9DCC8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tomm20Q9DCC8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tomm20Q9DCC8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tomm20Q9DCC8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm20Q9DCC8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm20Q9DCC8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm20Q9DCC8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm20Q9DCC8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm20Q9DCC8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm20Q9DCC8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm20Q9DCC8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm20Q9DCC8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm20Q9DCC8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm20Q9DCC8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm20Q9DCC8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tomm20Q9DCC8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms