Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smdt1Q9DB10 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smdt1Q9DB10 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms