Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc54Q9DAL3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc54Q9DAL3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc54Q9DAL3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms