Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAE8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAE8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAE8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAE8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DAE8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9DAE8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms