Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdzd9Q9D9M4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdzd9Q9D9M4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdzd9Q9D9M4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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