Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Actrt1Q9D9J3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms