Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8N1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D8N1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9D8N1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D8N1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D8N1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms