Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp19Q9D7A6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp19Q9D7A6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms