Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tube1Q9D6T1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tube1Q9D6T1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 450.3 ms