Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb4aQ9D6F9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubb4aQ9D6F9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubb4aQ9D6F9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms