Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tomm20lQ9D4V6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tomm20lQ9D4V6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms