Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubgcp4Q9D4F8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubgcp4Q9D4F8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubgcp4Q9D4F8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubgcp4Q9D4F8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubgcp4Q9D4F8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubgcp4Q9D4F8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubgcp4Q9D4F8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms